Silia bekerja sebagai nanomasin yang terdiri dari sekitar 600 protein dalam kompleks molekulernya, berfungsi secara independen. Dalam sel epitel, silia primer berfungsi sebagai antena seluler, yang memberikan kemosensasi, mekanosensasi, dan termosensasi dari lingkungan ekstraseluler. Mereka memediasi jalur sinyal seluler.

Silia motil juga memainkan peran sekretori hilir ke aliran fluida. Sebagian besar sel epitel adalah bersilia. Silia mencegah akumulasi debu di dalam tabung pernapasan, trakea dengan menciptakan lapisan tipis lendir di sepanjang trakea. Silia di sel fallopii memungkinkan lewatnya ovum sepanjang tuba Fallopii.