Membran plasma mengacu pada penghalang semipermeabel yang mengelilingi kompartemen sel. Membran plasma yang mengelilingi sel disebut membran sel. Membran plasma juga mengelilingi organel eukariota. Biasanya, organel adalah struktur dinamis yang melakukan fungsi tertentu di dalam sel. Oleh karena itu, untuk menjalankan fungsinya, bagian dalam organel haruslah lingkungan yang ditentukan. Ruang intraseluler organel yang berbeda juga dapat berbeda satu sama lain. Pemeliharaan homeostasis dari ruang ekstraseluler di dalam organel adalah fungsi dari membran plasma. Berdasarkan fungsi organel, struktur membran plasma yang mengelilingi organel juga berubah.

Beberapa membran plasma khusus untuk melakukan fungsi organel. Sebagai contoh, mitokondria adalah organel yang melakukan respirasi seluler pada eukariota. Dengan demikian, membran mitokondria terspesialisasi untuk melakukan rantai transpor elektron. Membran kloroplas juga khusus untuk melakukan fotosintesis. Vakuola sel tanaman juga tertutup oleh membran plasma.